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Ensayo de opinión del foro regulador: El papel del patólogo toxicológico en la era postgenómica: retos y oportunidades.

Las revoluciones de la “ómica”, el cribado de alto rendimiento, la modelización informática y la minería de bases de datos han llegado con predicciones estimulantes y señales de mano concretas, garantías para priorizar las pruebas de toxicidad y reducir la dependencia de las pruebas estándar. Si nos remitimos a la experiencia previa con diversos métodos y opciones de predicción, lo que sigue al frenesí por apoyar nuevos conocimientos prometedores o un método totalmente distinto de ensayo de toxicidad/carcinogenicidad son años de perfeccionamiento de los conocimientos para su verificación y mejora. Gran parte del entusiasmo por cada nuevo método y tecnología emergente es el paradigma de las pruebas biológicas con roedores, que son costosas, requieren mucho tiempo y a menudo son irrelevantes e ineficaces.

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Sin embargo, no hay que esperar que se abandonen todas las pruebas con animales en un futuro previsible, sobre todo para la exposición a productos agroquímicos y bioexóticos ambientales. Es barato esperar que el largo plazo proporcione, no obstante, nuevos enfoques para las pruebas de seguridad y la evaluación de amenazas humanas. En el pasado, cada nuevo método no estuvo a la altura de las expectativas infladas para las pruebas de seguridad y la evaluación de amenazas humanas, pero a menudo se ha convertido en una herramienta analítica útil con contribuciones tangibles a la biología elemental y la medicina científica.

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El toxicólogo se ha integrado en una matriz ambiental mixta especializada y se enfrenta a algunos retos importantes y alternativas posgenómicas fundamentales dentro de muchos años. Entonces, ¿qué consejos podemos dar a un toxicólogo oficial que esperamos que funcionen con éxito dentro de muchos años de genómica? ¿Y qué consejo adicional podemos dar a un patólogo de laboratorio experimentado que se enfrenta a una ciencia aplicada floreciente, acompañada de una desconcertante variedad de jerga técnica, para que pueda mantener su competencia como toxicólogo?

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Aproximaciones postgenómicas al uso de las Corynebacterias como bioestimuladores.

El glutamato de Corynebacterium revela bastantes rasgos intrínsecos excelentes como unidad de producción mayor y menor del metabolismo. La diversidad de este organismo siempre se ha llevado a cabo a escala industrial para proporcionar una variedad de aminoácidos con altos rendimientos y tasas de conversión, permitiendo el desarrollo de toda una industria. El periodo post-genómico proporciona una nueva plataforma tecnológica no sólo para mejorar aún más las propiedades intrínsecas de las células enteras de C. glutamicum como bioestimulantes, sino también para desarrollar la gama de productos que este organismo puede sintetizar sustancialmente, desde aminoácidos hasta compuestos químicos esenciales.

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EnoGene
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Este resumen aborda las estrategias y métodos de mejora del estrés que han permitido la información genómica y los métodos relacionados. Su aplicación ha permitido mejoras adicionales necesarias para la economía de la fabricación a escala industrial, ya que C. glutamicum y sus vástagos se utilizan como un sistema eficiente de vector huésped. Independientemente del rápido desarrollo de los conocimientos postgenómicos y de la rápida evolución de los conocimientos técnicos, el descubrimiento de fármacos sigue siendo un proceso largo y problemático. Para diseñar fármacos más sencillos es necesario comprender mejor la interacción entre los fármacos candidatos y las dianas/no dianas en muchas condiciones.

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La flexibilidad de la proteómica para combinar muchas disciplinas permite la evaluación directa de las acciones de las proteínas en una amplia gama de proteínas, lo que tiene un enorme potencial para facilitar la elucidación de dianas de fármacos y la investigación farmacológica principal. En los últimos años, la proteómica química ha experimentado un rápido desarrollo y ha proporcionado una técnica útil para la identificación de fármacos y el descubrimiento de inhibidores. Este resumen proporciona las ideas básicas y la ciencia aplicada para muchos enfoques proteómicos químicos estándar. También cubre opciones importantes y avances recientes en cada método, al tiempo que destaca su potencial para el descubrimiento y mejora de fármacos.

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DNA
MBS6507400-5x005mg MyBiosource
4-Amino Biphenyl DNA (4-AMBP DNA, 4-Aminobiphenyl DNA)
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4-Amino Biphenyl DNA (4-AMBP DNA, 4-Aminobiphenyl DNA)
MBS600356-5x01mL MyBiosource
T4 DNA Ligase (T4 DNA) Enzyme
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Predicción de regiones proteicas con selección y evaluación de características mRMR.

Los dominios son los elementos estructurales y funcionales de las proteínas. Con el torrente de secuencias proteicas generadas en la era post-genómica, existe una gran necesidad de desarrollar estrategias eficaces para la predicción de dominios proteicos basadas únicamente en información de secuencias, con el fin de facilitar la predicción de construcciones proteicas y acelerar la anotación de proteínas. Sin embargo, a pesar de los numerosos esfuerzos realizados en este sentido, la predicción de dominios proteicos a partir de datos de secuenciación sigue siendo un problema complejo y difícil de resolver. Aquí se ha desarrollado una nueva técnica que combina los métodos RF (random forest), mRMR (most relevant minimum frequency) e IFS (incremental feature selection).

Protein-Export Protein SecB (SecB) Protein
Abbexa
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Además de incorporar opciones de propiedades físicas y bioquímicas, conservación de secuencias, disfunción residual, construcción secundaria y accesibilidad a disolventes. La tasa de éxito global del nuevo método en un conjunto de datos independiente fue de alrededor del 73%, lo que supone aproximadamente un 28-40% más que el método predominante en el mismo conjunto de datos de referencia. Además, la evaluación en profundidad reveló que las opciones evolutivas, el rango de codones, el coste electrostático y la disfunción desempeñaban papeles más importantes que otros en la predicción de dominios proteicos, basándose en observaciones experimentales.

Fuentes :

  1. Gentaur
  2. NCBI
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Toronto Research Chemicals
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EWC Diagnostics
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